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DESCRIPTION:Ce module vise à fournir une expérience d’analyse de donné
 es de génomique.\nLes technologies Next Generation Sequencing (NGS) ont c
 onduit à une production massive de\ndonnées « Omiques » pour les plant
 es cultivées majeures\, ce qui demande de nouvelles\napproches d’analys
 es haut débit. La connaissance de ces approches et des outils qui en\ndé
 coulent pour analyser la séquence et la structure des génomes\, les anno
 ter et caractériser\nleur diversité et leurs profils d’expression perm
 et d’aborder des questions de recherche\nbiologique avancée sur la dive
 rsité et l’adaptation des plantes. Les espèces prises en\nconsidérati
 on sont des espèces phares des instituts de recherche agronomique de Mont
 pellier\net font partie des cultures les plus importantes pour l’agricul
 ture mondiale. Des plateformes\nd’outils bioinformatiques récents repos
 ant sur des centres de calcul et de stockage haute\ncapacité\, sont en pl
 ace pour analyser des jeux de données originales permettant de mieux\ncom
 prendre comment les génomes de plantes évoluent et s’expriment. L’en
 semble de ces\nconnaissances Findable\, Accessible\, Interoperable\, Reusa
 ble car intégré dans des systèmes\nd’information peut soutenir l'iden
 tification de gènes responsables de caractères adaptatifs ou\nde product
 ion. La mobilisation de jeunes chercheurs sur ces sujets est primordiale t
 ant la\ndemande est importante.\nLe module est structuré sous la forme de
  cours et de travaux tutorés avec la rencontre de\ngénéticiens et de bi
 oinformaticiens permettant d’appréhender les formes variées des progr
 ès\nen bioanalyse génomique. Il permet d’acquérir les lignes directri
 ces pour l’accès\, l'utilisation\net l'analyse de différents types de 
 données omique (e.g. (épi)génomique\, transcriptomique\,\nprotéique\, 
 métabolique) en vue d’accélérer les recherches en génomique fonction
 nelle et\nbiotechnologie des plantes.\nL’évaluation sera faite sur la b
 ase de la participation et de la qualité du projet proposé par\nl’étu
 diant en fin de module\, individuellement ou en binôme\, suivant les cons
 ignes détaillées en\ndébut de module
LOCATION:Salle 159 Batiment 3 CIRAD Lavalette\, Avenue Agropolis
SUMMARY:BIGomics\, Génomique Comparative Biopolis
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