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DESCRIPTION:Objectifs pédagogiques\nConnaître les concepts et méthodes b
 ioinformatiques utilisés pour l’analyse primaire de données issues de 
 séquenceurs nouvelle génération (NGS). Savoir effectuer un alignement s
 ur un génome de référence\, un assemblage de novo d’un génome bacté
 rien\n\nProgramme\nThéorie\n* Présentation des différents types de tech
 nologies de séquençage (lectures longues et courtes)\n\nPratique : Analy
 se des données de séquençage d’un génome bactérien\n* Contrôle qua
 lité\n* Assemblage de-novo\n* Nettoyage des données\n* Assemblage\n* Vis
 ualisation et statistiques sur l’assemblage\n* Alignement de lectures su
 r un génome de référence et visualisation\nTous les TPs seront réalis
 és sous l’environnement d’exécution de traitements Galaxy.
LOCATION:Centre INRAE\, bâtiment 233
SUMMARY:Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle géné
 ration sous Galaxy  : 2025
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