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DESCRIPTION:L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) organise en par
 tenariat avec iPOP-UP (représenté par EDC) une formation sur les langage
 s de workflows en bioinformatique à destination des bioinformaticien·ne
 ·s et des bioanalystes. La formation abordera les fondamentaux et les fon
 ctionnalités avancées des deux langages Snakemake et Nextflow. Ces outil
 s sont en effet devenus indispensables pour assurer la reproductibilité e
 t l’efficacité des analyses bioinformatiques. La formation sera structu
 rée en deux séquences :\n- une journée commune qui abordera les grands 
 principes des gestionnaires de workflow\, en particulier dans le domaine d
 e la bioinformatique et en lien avec les infrastructures de calcul de type
  cluster et cloud proposés au sein de l’IFB \n- une  journée de sessio
 n pratique  avec 1 atelier snakemake et 1 atelier nextflow en parallèle a
 u choix des participants. Nous proposons aux participants qui le souhaiten
 t de travailler sur leur propre workflow dans une approche “Bring your o
 wn script” avec l’aide de l’équipe pédagogique.
SUMMARY:Les langages de workflows pour une analyse bioinformatique reproduc
 tible / Workflow languages for reproducible bioinformatics analysis
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