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DESCRIPTION:Introduction aux bonnes pratiques en bio-informatique afin de p
 érenniser son travail de recherche.\n\nCette formation permet de découvr
 ir les bonnes pratiques dans le cadre d’un travail nécessitant des appr
 oches programmatiques (statistiques\, programmation d’outils\, analyses 
 de données biologiques). Elle s’inscrit aussi dans l’aspect science-o
 uverte afin de rendre plus facilement disponible et pérenne le travail bi
 o-informatique. Après une introduction aux pratiques FAIR axées notammen
 t sur les notions de reproductibilité et de répétabilité du code\, plu
 sieurs approches seront abordées: les bonnes pratiques de partage et gest
 ion des versions des outils utilisés \; la gestion des environnements de 
 travail (conda\, docker\, singularity) \; découverte du gestionnaire de w
 orkflow Snakemake : et enfin la documentation du code avec Rmarkdown et Ju
 pyter.
LOCATION:7\, avenue Blaise Pascal
SUMMARY:New session of FAIR_bioinfo_@_AuBi
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 ormatique-pour-des-analyses-reproductibles
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